因为冬季施工不便的原因，杉木桩往往需要长期存放，需要进行一定的防腐处理。常用的防腐方式为灼烧或者涂抹沥青防腐层。灼烧这种方式由来已久，就是将杉木桩外层烧成炭黑，碳是一种稳定的物质，可以保持长时间的防腐。沥青防腐和油漆类似，沥青图层可以将木材和空气进行隔绝。
一般松木桩不做防腐处理，就是从山上采下来活木松马上打泥里，古人说的好：“松木是干千年湿千年， 不干不湿就半年”。记得在钱江海定盐关海塘治理时，从海水泥里清出清朝打下的松木桩与现在才从山上采伐 松木没有两样。松木桩防腐习惯做法是：将松木桩表面进行轻度炭化，及用火将其表面层烤焦，再图上沥青，就行了现在 一般不采用这种方法，但是，对于临时性建筑还是一个不错的方法，简单、经济、实用，尤其是有挖机配合松 木桩，进行施工更方便啦。
